Prerekvizity a požadované vedomosti: Uchádzač nemusí mať žiadne vedomosti o práci v systéme Linux a biológii, stačí mu základná znalosť práce s počítačom.
Informačný list kurzu: Prehľad, filozofia a štruktúra linuxových systémov. Praktické úlohy v jednej z najpopulárnejších linuxových distribúcii – Ubuntu. Použitie základnych príkazov a práca v súborovom systéme. Inštalácia potrebných bioinformatických balíčkov. Základy práce v knižnici samtools. Vyhodnotenie čítaní pomocou nástroja FastQC.
Nadobudnuté vedomosti: Filozofia Linuxových systémov, základy práce so súbormi, inštalácia softvérových balíčkov, spúštanie skriptov. Použitie štandardných konzolových bioinformatických nástrojov a vyhodnotenie kvality genomických dát.
Trvanie kurzu: 2-3 dni